Museon toimialoja ovat kulttuurihistoria, kuvataide, rakennettu kulttuuriympäristö ja luonnontiede. Museo toimii Itäisen Uudenmaan maakuntamuseona ja vastaa myös J. L. Runebergin kodin, Walter Runebergin veistoskokoelman sekä Porvoon kaupungin taidekokoelman museaalisesta hoidosta.