Vesistöjen laadun seurantaa tehdään lähinnä velvoitetarkkailutulosten perusteella. Seurattavia vesistöjä ovat pistekuormituksen alaiset järvet: Kiteenjärvi, Ätäskö, Puhoslampi, Orivesi ja Sirkkajoki-Lepikonjoki ja Pyhäjärvi. Lisäksi kesäisin tehdään reaaliaikaista levätarkkailua Kiteenjärvestä, Orivedestä ja Pyhäjärvestä.
Valtakunnallista leväseurantaa koordinoi Suomen ympäristökeskus (SYKE) ja s ...