Alavudella erityisen tuen päätökset (huoltajien ja opettajien hakemuksen perusteella) tekee opetuspäällikkö.
Jos oppilas ei ryhmäkohtaisista tukimuodoista ja oppilaskohtaisista tukitoimista huolimatta pysty suoriutumaan hyväksytysti perusopetuksen oppimäärästä tai opetussuunnitelman mukaisista tavoitteista, niistä voidaan poiketa. Poikkeamispäätökseen vaaditaan oppilaasta tehty oppilaskohtaisen tuen tarpeen arviointi ja oppilaskohtaisen tuen toteuttamista koskeva suunnitelma.
Oppilaalle voidaan muodostaa opetussuunnitelman tavoitteista erilaajuisia tavoitekokonaisuuksia. Oppilaan tulee suorittaa tavoitekokonaisuudet hyväksytysti, jotta hän voi edetä kyseisessä oppiaineessa.
Oppiaineen oppimäärän tavoitteita ja sisältöjä voidaan myös rajata. Tämä koskee vain sellaisia oppilaita, jotka saavat oppilaskohtaisena tukitoimena erityisopettajan tai erityisluokanopettajan opetusta pienryhmässä tai erityisluokanopettajan opetusta erityisluokassa. Myös oppilaan tilapäinen vapauttaminen jostakin oppiaineesta kokonaan on mahdollista, jos hän ei kykene opiskelemaan ainetta terveydellisistä syistä.